单细胞与单核转录组
解析细胞组成与状态解析细胞组成、亚群与状态,将候选表达变化联系到相应细胞群。
- 细胞与基因质控、样本整合和聚类
- 标记基因与细胞类型注释、分组比较
- 功能评分、通讯推断与拟时序分析
方案与适用条件
可回答的问题
- 样本包含哪些细胞群与亚群?
- 不同条件下,哪些细胞状态发生变化?
- 候选基因主要在哪些细胞中表达?
对应成果
- 质控汇总与细胞注释结果
- UMAP、标记基因及表达图表
- 差异、通路和研究问题分析报告
数据准备
原始测序文件或表达矩阵、样本分组与实验背景;测序方案需结合组织类型、样本质量和研究目标评估。
方法与边界
可根据数据采用 Seurat、批次整合、AUCell、CellChat 等方法。拟时序描述表达状态的相对排列,不直接等同于真实时间或谱系证据。
